Juanjo Guarnido est né à Grenade, en Espagne, en 1967. Il passe son enfance à dessiner au village de Salobrena, au bord de la Méditerranée. Plus tard, sa famille s’installe à Grenade, où il fait ses études de Beaux-Arts et où il obtient son diplôme. Juanjo Guarnido participe à la confection de plusieurs fanzines grenadins. Durant ces années, il publie de nombreuses illustrations chez Comics Forum – Planeta de Agostini pour l’édition espagnole de Marvel, ce qui lui permet de toucher un public espagnol assez large. Juanjo Guarnido prend ensuite contact avec le milieu du dessin animé et s’installe à Madrid où, pendant trois ans, il travaillera pour plusieurs séries télé. Le premier jour dans le studio, il rencontre Juan Diaz Canales, qui deviendra son scénariste sur Blacksad. En 1993, Juanjo Guarnido déménage à Paris pour intégrer les Studios Walt Disney de Montreuil, où il travaille comme lay-out-man et comme animateur. Adepte depuis toujours de la BD européenne, il entreprend patiemment ce qui sera la longue fabrication de son premier album. Quelque part entre les ombres, le tome 1 de Blacksad, est son premier album. Entre deux albums de Blacksad, Juanjo Guarnido débute une série jeunesse, Sorcelleries toujours chez Dargaud. En 2019, il dessine le deuxième tome de la série Les Indes Fourbes chez Delcourt.